Ще в першому кварталі 2016 року підприємство було збитковим і фінансувалося за рахунок державних коштів. У поточному 2017 році ДП «Прозорро» планує взагалі відмовитися від бюджетних коштів. Головна сума доходу надходить від операторів офіційних інтернет майданчиків.
На підставі фінансових показників за 2016 рік, ДП «Прозорро» планує знизити в 2017 році чистий прибуток, за рахунок зниження плати за участь у закупівлях, що знімається з операторів. На сьогодні така плата складає від 400 до 5000 гривень в залежності від обсягу і суми закупівлі.